Aéreas: Posee el aeropuerto 3 de M​ayo con una longitud de 1 Km con 700 m, desde donde se puede viajar a Cali, Bogotá, Medellín, Neiva y Puerto Leguizamo.

Terrestres: Carretera Mocoa - Pasto (227 kms); Carretera Paujil - Orito - La Hormiga (105 Kms)

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Fluviales: Cuenta con el principal afluente, el Río Putumayo a cinco Kms de casco urbano se encuentra el Puerto Hong-kong.​​